Antes de que Kosovo declarara su independencia el 17 de febrero de 2008, nunca había tenido el estatus político que le permitiera una bandera propia. Después de la Segunda Guerra Mundial, Kosovo se incorporó a la Yugoslavia socialista como una región autónoma (más tarde provincia autónoma) de la República de Serbia. El gobierno federal autorizó banderas solo para las varias repúblicas constituyentes yugoslavas. Sin embargo, a los albaneses étnicos que viven en Kosovo finalmente se les permitió enarbolar la bandera albanesa.
Kosovo siguió siendo parte de Serbia tras la disolución de la Yugoslavia socialista a principios de la década de 1990, pero un movimiento separatista en la provincia ganó fuerza a lo largo de la década. En 1998, Serbia emprendió acciones punitivas contra los separatistas en Kosovo, que en 1999 fue contrarrestada por la Organización del Tratado del Atlántico Norte (OTAN). Kosovo fue puesto bajo la administración de las Naciones Unidas, que permaneció allí después de la proclamación de independencia de Kosovo en 2008 hasta que fue reemplazado en gran parte en 2009 por funcionarios de la Unión Europea (UE). Serbia y un gran número de otros países siguieron oponiéndose a esa declaración de independencia.
Se realizó una competencia formal para seleccionar una bandera nacional para Kosovo. Gran parte de las entradas se basaron en el diseño de la bandera albanesa, ya sea directa o indirectamente. El patrón elegido, influenciado por la bandera de la UE, hizo una declaración clara enfatizando a Kosovo como un país multiétnico. Los colores azul y amarillo de la bandera de la UE se utilizaron para el fondo y la silueta de la bandera del territorio nacional, respectivamente, y el círculo de estrellas blancas de la bandera de la UE fue paralelo al arco de estrellas blancas en la bandera de Kosovo. Se decía que las estrellas representaban los seis grupos étnicos predominantes del país (albaneses, bosnios, goranis, romaníes, serbios y turcos). Sin embargo, los residentes de etnia albanesa y serbia en Kosovo continuaron haciendo uso de sus respectivas banderas nacionales.
