El Partido Africano para la Independencia de Guinea y Cabo Verde (PAIGC) encontró apoyo en esas colonias portuguesas para su mensaje de avance social y económico a través de la revolución política. En 1961 adoptó una bandera algo similar a la de los países vecinos independientes de Guinea y Ghana, que luego discutían una futura federación de tierras de África occidental. A su pan-africano rojo-amarillo-verde, el movimiento de liberación de Guinea-Bissau agregó una estrella negra en la franja de elevación. Esa franja y estrella correspondieron geográficamente a la región costera occidental con su ciudad capital, Bissau (de donde se deriva el nombre nacional). Las rayas horizontales en la parte restante de la bandera y sus colores amarillo y verde correspondían aproximadamente a las sabanas del norte y los bosques del sur.
Oficialmente, se decía que la estrella negra era un símbolo del liderazgo de PAIGC, su color se refería al pueblo africano y su determinación de vivir con dignidad, libertad y paz. El amarillo fue interpretado como un símbolo de la cosecha y los frutos del trabajo, tanto en la agricultura como en otros. Green recordó las vastas selvas y las tierras agrícolas, que proporcionaron un medio de vida para la gran mayoría de los ciudadanos. La bandera del partido también incorporó las iniciales PAIGC, omitidas cuando se proclamó la independencia el 24 de septiembre de 1973. Portugal no reconoció a Guinea-Bissau ni a su bandera hasta después de su propia revolución en 1974; sin embargo, gran parte de Guinea-Bissau ya estaba bajo el control del PAIGC y su bandera. Cabo Verde finalmente abandonó la política marxista del PAIGC y cambió su bandera nacional, pero Guinea-Bissau conserva el diseño original.
